More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2055 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2055  rare lipoprotein A  100 
 
 
201 aa  393  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  55.56 
 
 
160 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  55.56 
 
 
160 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.17 
 
 
258 aa  104  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
214 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
370 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  42.96 
 
 
297 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  48 
 
 
278 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
324 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  51.96 
 
 
297 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  49.02 
 
 
251 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  49.07 
 
 
261 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
284 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
198 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
285 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
367 aa  98.2  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  40.43 
 
 
263 aa  98.6  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  51.52 
 
 
371 aa  98.2  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  33.66 
 
 
265 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  48.98 
 
 
249 aa  98.2  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  47 
 
 
273 aa  97.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  32.57 
 
 
267 aa  97.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  33.82 
 
 
264 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  47 
 
 
273 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  39.1 
 
 
260 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  49.51 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  48.28 
 
 
381 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
259 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
150 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  48.04 
 
 
267 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.04 
 
 
323 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  48.98 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  47.46 
 
 
322 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.94 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  45.1 
 
 
247 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
303 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
114 aa  94.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
255 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  46.24 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  46.24 
 
 
206 aa  94  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  54 
 
 
116 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.81 
 
 
239 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  47.06 
 
 
290 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
142 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
144 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
155 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  47.42 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
124 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  34.97 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  36.48 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
171 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  45.54 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  38.85 
 
 
318 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  36.18 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  44.74 
 
 
270 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
324 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
124 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  49.48 
 
 
173 aa  92.4  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
145 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
266 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
321 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
124 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
275 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
275 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  34.64 
 
 
269 aa  92  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.17 
 
 
286 aa  92  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  44.07 
 
 
471 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  47.37 
 
 
118 aa  91.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  47.37 
 
 
118 aa  91.7  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
124 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  42.4 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
227 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
142 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  46.81 
 
 
339 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  35.37 
 
 
163 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  45.37 
 
 
257 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  45.1 
 
 
163 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
394 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  46.85 
 
 
367 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  49.46 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  52.87 
 
 
144 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  40.62 
 
 
270 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  49 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  48.51 
 
 
119 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
358 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
124 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  39.52 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  53.49 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  47.42 
 
 
282 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
124 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  49.51 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  50 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>