More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2256 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 507 aa  1003    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  95.66 
 
 		 507 aa  924    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.86 
 
 		 507 aa  926    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.31 
 
 		 513 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.71 
 
 		 532 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.58 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.42 
 
 		 509 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.07 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.56 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.89 
 
 		 508 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.42 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.27 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  54.15 
 
 		 514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  52.61 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.15 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.3 
 
 		 511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.69 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.38 
 
 		 513 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.16 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.81 
 
 		 526 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.39 
 
 		 527 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  53.11 
 
 		 514 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.04 
 
 		 527 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.64 
 
 		 529 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.4 
 
 		 513 aa  485  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.89 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.2 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.49 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.52 
 
 		 518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.47 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.76 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.03 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.14 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.29 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.77 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 532 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 		 521 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.79 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  39.36 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.36 
 
 		 511 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.52 
 
 		 537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 520 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.17 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.12 
 
 		 510 aa  340  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.12 
 
 		 503 aa  340  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 514 aa  336  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  36.23 
 
 		 526 aa  332  7.000000000000001e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.76 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  35.81 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.64 
 
 		 530 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 511 aa  323  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  35.23 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.57 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  35.54 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 530 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 530 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 530 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.12 
 
 		 529 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.57 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.57 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.57 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 525 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 530 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.01 
 
 		 526 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.36 
 
 		 517 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 534 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 534 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 		 536 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  34.77 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 		 519 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  36.73 
 
 		 525 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
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NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 519 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 		 519 aa  301  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.16 
 
 		 532 aa  301  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 		 519 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
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NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 519 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  34.94 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  34.94 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  36.4 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 		 519 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
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