More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3040 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  100 
 
 		 381 aa  764    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  54.26 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  51.82 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  46.46 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  40.32 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  40.77 
 
 		 398 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  40.36 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  44.24 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  37.94 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  35.15 
 
 		 389 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  35.01 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  35.28 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  34.64 
 
 		 384 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  32.99 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.69 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  32.48 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  30.53 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  30 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  29.55 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.98 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.13 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  29.07 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.29 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.89 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.12 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  31.19 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.01 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.8 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  28.87 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  28.27 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  28.27 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27.81 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  28.13 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  29.84 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  34.35 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  32.1 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  31.47 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25.67 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  32.31 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  30.09 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  28.81 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  26.81 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.79 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  31.02 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  27.27 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  28.32 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  25.32 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  29.55 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  26.78 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.78 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  29.87 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  30.64 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  28.19 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.3 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  26.6 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  27.34 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.57 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26.57 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  29.08 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  26.57 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  27.23 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.57 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.57 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  26.57 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  25.86 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  26.15 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  25.09 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  31.11 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  29.69 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.47 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  26.44 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  21.72 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  27.07 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  27.37 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  28.44 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  27.38 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.79 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.65 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  29.3 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  29.88 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  28.65 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2766  kynureninase  26.64 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  27.16 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  26.23 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  25.72 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  29.05 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  27.44 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.37 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>