More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2440 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  99.36 
 
 		 786 aa  1613    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  60.41 
 
 		 781 aa  939    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  46.22 
 
 		 722 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  46.14 
 
 		 728 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.53 
 
 		 788 aa  978    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  61.49 
 
 		 848 aa  966    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  47.38 
 
 		 726 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  91.81 
 
 		 829 aa  1511    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  45.21 
 
 		 724 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  64.14 
 
 		 787 aa  1025    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  45.83 
 
 		 721 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  46.21 
 
 		 722 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  46.47 
 
 		 727 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 786 aa  1619    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  69.01 
 
 		 783 aa  1123    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  68.04 
 
 		 787 aa  1109    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  45.86 
 
 		 727 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  59.29 
 
 		 713 aa  887    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  69.71 
 
 		 790 aa  1137    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  45.47 
 
 		 724 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  79.27 
 
 		 786 aa  1287    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  57.4 
 
 		 726 aa  850    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  46.18 
 
 		 726 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  60.66 
 
 		 822 aa  944    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  67.92 
 
 		 787 aa  1108    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  62.78 
 
 		 809 aa  993    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  46.96 
 
 		 727 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  45.08 
 
 		 723 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  69.04 
 
 		 787 aa  1129    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  68.04 
 
 		 787 aa  1109    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  45.17 
 
 		 724 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  46.42 
 
 		 741 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  46.17 
 
 		 730 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  61.01 
 
 		 793 aa  940    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  68.04 
 
 		 787 aa  1109    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  57.44 
 
 		 743 aa  889    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  45.34 
 
 		 721 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  68.29 
 
 		 787 aa  1114    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  68.04 
 
 		 787 aa  1109    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  63.53 
 
 		 788 aa  1013    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  44.79 
 
 		 726 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  46.1 
 
 		 722 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  61.77 
 
 		 814 aa  986    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  57.63 
 
 		 731 aa  869    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.93 
 
 		 825 aa  995    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  69.06 
 
 		 783 aa  1120    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  45.08 
 
 		 722 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  45.55 
 
 		 729 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.74 
 
 		 739 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  77.55 
 
 		 787 aa  1261    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  44.95 
 
 		 723 aa  667    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  63.35 
 
 		 818 aa  991    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  70.25 
 
 		 786 aa  1147    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  68.09 
 
 		 787 aa  1108    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  69.54 
 
 		 846 aa  1135    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  67.92 
 
 		 787 aa  1108    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.01 
 
 		 816 aa  964    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  44.46 
 
 		 724 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  46.1 
 
 		 722 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  46.02 
 
 		 728 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  69.66 
 
 		 787 aa  1135    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  45.65 
 
 		 721 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  48.18 
 
 		 721 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  62.14 
 
 		 826 aa  967    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  46.09 
 
 		 722 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  45.71 
 
 		 722 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.83 
 
 		 725 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  46.09 
 
 		 727 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  60.73 
 
 		 744 aa  927    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  45.88 
 
 		 728 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  70.04 
 
 		 840 aa  1137    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  46.08 
 
 		 728 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  46.2 
 
 		 728 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  70.04 
 
 		 787 aa  1138    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  69.54 
 
 		 787 aa  1135    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  45.83 
 
 		 722 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  46.14 
 
 		 728 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  46.1 
 
 		 722 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  46.29 
 
 		 727 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  46.1 
 
 		 722 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  45.03 
 
 		 721 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  44.58 
 
 		 720 aa  634  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  44.71 
 
 		 720 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  44.42 
 
 		 734 aa  635  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  44.46 
 
 		 720 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  43.76 
 
 		 726 aa  635  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  44.58 
 
 		 720 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  45.34 
 
 		 728 aa  631  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  44.89 
 
 		 721 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  45.02 
 
 		 721 aa  632  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 723 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  44.43 
 
 		 724 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  43.7 
 
 		 737 aa  632  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  44.44 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  45.63 
 
 		 725 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  43.7 
 
 		 720 aa  625  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  43.7 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  43.83 
 
 		 720 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  43.7 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  43.7 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>