More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5060 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  51.84 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1327  hypothetical protein  50.76 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6352  hypothetical protein  44.65 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997284  normal  0.0840681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.14 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.15 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.16 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.16 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  47.02 
 
 		 386 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.7 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.9 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.4 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.99 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.35 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.29 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.6 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.29 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.29 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.15 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  42.32 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.46 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.46 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.38 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.69 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.41 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.14 
 
 		 339 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.23 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.94 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  42.95 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  41.69 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.41 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.69 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.05 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.9 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.04 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.65 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.21 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.72 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.18 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.62 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.17 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.41 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.84 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.94 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.32 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  43 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.32 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.04 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.63 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.15 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.2 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.71 
 
 		 335 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  41.39 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.37 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.53 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.47 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.08 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.41 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4820  hypothetical protein  41.69 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.3 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.68 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  41.33 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  41.59 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.19 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.68 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.21 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  41.28 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.95 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.48 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.98 
 
 		 330 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 329 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  41.81 
 
 		 351 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.51 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  41.78 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.73 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  41.52 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.84 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  38.13 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.28 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.53 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.3 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.21 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.42 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>