More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1563 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  81.21 
 
 		 593 aa  928    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 603 aa  1180    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  52.45 
 
 		 579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  51.59 
 
 		 600 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  52.18 
 
 		 577 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  53.56 
 
 		 582 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  52.4 
 
 		 581 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  52.9 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  55.35 
 
 		 614 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  52 
 
 		 582 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  52 
 
 		 582 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  50.79 
 
 		 582 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  47.2 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  47.2 
 
 		 588 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  49.73 
 
 		 667 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  48.2 
 
 		 589 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.99 
 
 		 583 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  49.64 
 
 		 592 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  49.36 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  48.99 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  48.36 
 
 		 574 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  44.75 
 
 		 578 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  44.94 
 
 		 578 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  44.38 
 
 		 578 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.98 
 
 		 585 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0244  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.91 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  41.73 
 
 		 580 aa  435  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.15 
 
 		 584 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  45.45 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.15 
 
 		 591 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  43.5 
 
 		 643 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.11 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  42.28 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.2 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.59 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  42.48 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  43.17 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  43.35 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  44.75 
 
 		 598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.08 
 
 		 596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  43.07 
 
 		 578 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  45.45 
 
 		 580 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  39.38 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  42.43 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  38.41 
 
 		 603 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  40.42 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  41.51 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  42.48 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.59 
 
 		 574 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  39.96 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  42.68 
 
 		 587 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.51 
 
 		 595 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  42.19 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.98 
 
 		 560 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  40.66 
 
 		 602 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  37.91 
 
 		 570 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.75 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  40.48 
 
 		 602 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  40.11 
 
 		 602 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  40.38 
 
 		 619 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  42.7 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  42.1 
 
 		 580 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  42.15 
 
 		 593 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  41.93 
 
 		 575 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.59 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.06 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  39.25 
 
 		 589 aa  364  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  38.13 
 
 		 573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  37.81 
 
 		 571 aa  362  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  36.38 
 
 		 590 aa  362  8e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  38.91 
 
 		 668 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  40.18 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  40.21 
 
 		 575 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.65 
 
 		 671 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  38.93 
 
 		 576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  39.74 
 
 		 573 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  38.53 
 
 		 591 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  41.61 
 
 		 581 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  42.13 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  40.27 
 
 		 535 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  37.34 
 
 		 573 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  36.91 
 
 		 577 aa  353  7e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  45.79 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  36.33 
 
 		 581 aa  350  6e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  45.98 
 
 		 596 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  39.17 
 
 		 582 aa  347  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  38.8 
 
 		 589 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.32 
 
 		 563 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  38.52 
 
 		 576 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  37.43 
 
 		 591 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.15 
 
 		 587 aa  339  7e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  38.1 
 
 		 663 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  39.08 
 
 		 569 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  42.96 
 
 		 575 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  38.88 
 
 		 742 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  36.48 
 
 		 782 aa  329  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  38.83 
 
 		 582 aa  327  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  36.7 
 
 		 764 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.67 
 
 		 582 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>