More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0412 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  56.81 
 
 		 607 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  56.81 
 
 		 607 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.59 
 
 		 598 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 609 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  55.74 
 
 		 604 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 609 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 		 606 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  63.08 
 
 		 609 aa  801    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.94 
 
 		 606 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.3 
 
 		 609 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  57 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  76.57 
 
 		 608 aa  971    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  78.75 
 
 		 608 aa  989    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  55.74 
 
 		 603 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 609 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  56.26 
 
 		 607 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  64.88 
 
 		 615 aa  817    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  82.37 
 
 		 607 aa  1033    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  56.81 
 
 		 607 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  56.26 
 
 		 607 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  56.26 
 
 		 607 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  55.83 
 
 		 610 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  78.42 
 
 		 608 aa  989    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.95 
 
 		 613 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 		 601 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  56.93 
 
 		 608 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 606 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  62.42 
 
 		 614 aa  789    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  57.43 
 
 		 610 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  84.21 
 
 		 614 aa  1062    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 		 614 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 		 609 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 606 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  62.17 
 
 		 606 aa  801    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  55.06 
 
 		 602 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  57 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  83.83 
 
 		 608 aa  1047    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  56.81 
 
 		 607 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 		 605 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 		 598 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 603 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 607 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  56.91 
 
 		 608 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  61.68 
 
 		 606 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 		 607 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 603 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  55.07 
 
 		 607 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  69.8 
 
 		 613 aa  839    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 603 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  57.03 
 
 		 608 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  78.91 
 
 		 608 aa  993    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  96.54 
 
 		 607 aa  1166    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  64.93 
 
 		 614 aa  827    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 596 aa  678    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  61.92 
 
 		 614 aa  786    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  59.9 
 
 		 606 aa  754    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 		 607 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 608 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  92.75 
 
 		 607 aa  1145    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  57.45 
 
 		 602 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  56.81 
 
 		 607 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  57.02 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  55.65 
 
 		 603 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  96.21 
 
 		 607 aa  1162    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  65.49 
 
 		 607 aa  804    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  90.77 
 
 		 627 aa  1117    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  63.37 
 
 		 610 aa  784    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  56.68 
 
 		 607 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 		 599 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 		 607 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  61.18 
 
 		 606 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  66.5 
 
 		 610 aa  838    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 608 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  55.06 
 
 		 623 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  78.75 
 
 		 607 aa  989    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  56.81 
 
 		 607 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  80.84 
 
 		 609 aa  1002    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  62.17 
 
 		 606 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  55.91 
 
 		 603 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  55.91 
 
 		 603 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1704  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 606 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 603 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  85.86 
 
 		 608 aa  1073    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  57 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  79.24 
 
 		 608 aa  996    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  61.39 
 
 		 605 aa  771    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 		 606 aa  782    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0861  GTP-binding protein TypA  62.71 
 
 		 610 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  79.7 
 
 		 606 aa  994    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 608 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  56.7 
 
 		 608 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 		 611 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 603 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  83.69 
 
 		 607 aa  1054    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>