119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1096 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1192    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  84.3 
 
 		 604 aa  1017    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  50.45 
 
 		 803 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  48.66 
 
 		 801 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  43.21 
 
 		 891 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  45.09 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  29.12 
 
 		 1276 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  31.02 
 
 		 662 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  30 
 
 		 1141 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  32.95 
 
 		 444 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  27.24 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  28.88 
 
 		 596 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  28.3 
 
 		 444 aa  120  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.25 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.92 
 
 		 584 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  31.22 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 437 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  30.51 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  30.14 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  28.85 
 
 		 605 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  28.49 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  28.49 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  28.49 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  28.26 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  29.72 
 
 		 873 aa  100  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  28.62 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  28.44 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  28.78 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26.61 
 
 		 481 aa  90.5  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  27.27 
 
 		 564 aa  88.2  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  28.77 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  26.01 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  27.92 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  27.55 
 
 		 597 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  28.27 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1086 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 1025 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  31.68 
 
 		 307 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.23 
 
 		 425 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  28.73 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  25.46 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  27.76 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  23.67 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.07 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  26.69 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  23.88 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.63 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  27.06 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  26.39 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  33.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  33.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  33.74 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  24.07 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  27.91 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  33.13 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  34.09 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  25.78 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  26.13 
 
 		 601 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  25.4 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.63 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  27.5 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.55 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  28.93 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  27.5 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.57 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0928  hypothetical protein  32.5 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0925  hypothetical protein  32.5 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0675759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  26.88 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  26.88 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  31.87 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  28.66 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  23.55 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.66 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0877  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  24.93 
 
 		 482 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  22.95 
 
 		 408 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 672 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  22.89 
 
 		 476 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  25.61 
 
 		 461 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  25.61 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  27.19 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3223  hypothetical protein  27.67 
 
 		 289 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.226821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>