More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5295 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 347 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  82.85 
 
 		 358 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 337 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  43.41 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  43.41 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  45.15 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  42.18 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 338 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  40 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  29.08 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2508  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  25.39 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  25.08 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  23.48 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  24.92 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  26.3 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.05 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.2 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>