More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1906 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  83.44 
 
 		 330 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  51.26 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.94 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  54.52 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  52.54 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  53.4 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  48.75 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.66 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.66 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52.36 
 
 		 339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  49.66 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50.31 
 
 		 328 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  54.49 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  53.18 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  49.37 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.23 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  51.52 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.14 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50.51 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  51.3 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  51.3 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  49.66 
 
 		 314 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.68 
 
 		 325 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  48.84 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  51.83 
 
 		 360 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  46.3 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  48.12 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  48.57 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  50.32 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  51.16 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  49.83 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.3 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.3 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.69 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.81 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  48.01 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  46.94 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  50.17 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.32 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  47.5 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  47.7 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.77 
 
 		 349 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.69 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.92 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.98 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.44 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  43.73 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.38 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.1 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.1 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  47.12 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.99 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.77 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  47.16 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.76 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  47.96 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.66 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.62 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.13 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.16 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  46.6 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  47.52 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.6 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.64 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  49.32 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  46.78 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  47.3 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.62 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.48 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.86 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  47.84 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.4 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  44.38 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.76 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.9 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  47.96 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  46.56 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.34 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.54 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  45.28 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  45.31 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.62 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.88 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.7 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  48.11 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.62 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.88 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  46.26 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.77 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.3 
 
 		 335 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.41 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.81 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  48.14 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  46.96 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  44.26 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  47.64 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.85 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.32 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>