More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1658 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 290 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  48.08 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  48.39 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.25 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  47.33 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  46.81 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  47.33 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 		 301 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 292 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.62 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.62 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 294 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  48.72 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.83 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 296 aa  252  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  48.21 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  43.32 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  44.96 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 288 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 291 aa  245  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  44.84 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  47.35 
 
 		 292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.43 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  46.62 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  47.99 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>