More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1431 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  73.21 
 
 		 170 aa  251  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  78.17 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  70 
 
 		 165 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  76.13 
 
 		 164 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  68.45 
 
 		 169 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  68.12 
 
 		 164 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  72 
 
 		 165 aa  227  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  63.31 
 
 		 167 aa  213  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  63.25 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  61.01 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  60.38 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  58.68 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  58.54 
 
 		 173 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  56.4 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  55.81 
 
 		 172 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  55.49 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  56.02 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  55.42 
 
 		 166 aa  183  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  56.02 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  56.02 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  56.02 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  54.82 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  53.61 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  54.22 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  53.74 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  50.34 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  52.41 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  46.34 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  51.63 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.71 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 173 aa  143  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  49.33 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  48.67 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  52.17 
 
 		 159 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  48.68 
 
 		 359 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.67 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  48.68 
 
 		 359 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  40.7 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  50.79 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.95 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  42.33 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  46.36 
 
 		 364 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  43.29 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  43.29 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  50.36 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  43.29 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  47.06 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  43.29 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  46.25 
 
 		 358 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>