137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5917 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 113 aa  226  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 76 aa  50.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  37.88 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.89 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3028  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.84966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2729  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.909696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2616  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  40.91 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2645  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.404416  normal  0.0532346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  32.31 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 1143 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  34.43 
 
 		 347 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 348 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1284  helix-turn-helix domain protein  34.18 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.4 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1249  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0411153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1258  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2729  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1874  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  35 
 
 		 113 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 115 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 100 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  34.62 
 
 		 81 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 76 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 188 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 91 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 176 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 81 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 99 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  32.39 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>