More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3627 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  866    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  85.17 
 
 		 436 aa  702    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  70.77 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  70.3 
 
 		 438 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  70.07 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  73.49 
 
 		 435 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  69.52 
 
 		 429 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  69.72 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  70.95 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  70 
 
 		 429 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  70.6 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  69.76 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  69.05 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  70.52 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  70.52 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  71.76 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  71.76 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  71.76 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  71.76 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  71.76 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  70.16 
 
 		 461 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  70.6 
 
 		 465 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  69.93 
 
 		 458 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  69.93 
 
 		 458 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  70.16 
 
 		 436 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  70.16 
 
 		 436 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  69.67 
 
 		 436 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  70.52 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  66.03 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  66.51 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  62.65 
 
 		 459 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  63.57 
 
 		 437 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  62.65 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  64.82 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  65.12 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  63.27 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  65.47 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  65.12 
 
 		 442 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  65.38 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  63.64 
 
 		 445 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  60.52 
 
 		 442 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  58.51 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  60.8 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  58.39 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  57.76 
 
 		 487 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  58.54 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  58.54 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  57.55 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  56.68 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  51.54 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  53.26 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  51.79 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  45.79 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  46.75 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  47.01 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  46.63 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  51.07 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  51.31 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  45.99 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  51.31 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  44.29 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  40.66 
 
 		 431 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  40.71 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  40.71 
 
 		 443 aa  299  9e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  37.91 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  37.91 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  37.68 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.29 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 434 aa  239  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.02 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  33.1 
 
 		 482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 485 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.59 
 
 		 485 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 485 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  36.39 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  33.89 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.59 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  36.06 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  31.59 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  35.21 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.95 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  30.97 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>