More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1785 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  47.12 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  44.71 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  43.87 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 282 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  38.61 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  38.61 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  41.67 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  39.13 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  35.1 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  35.58 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  37.07 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  36.1 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.61 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.61 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  38.35 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.61 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  36.23 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  37.31 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  36.71 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  35.75 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 209 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>