More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0112 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  54.89 
 
 		 324 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  53.46 
 
 		 324 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  55.33 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  54.61 
 
 		 325 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  52.16 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  53.85 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  56.38 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  55.63 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  50.75 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  49.42 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  46.04 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  48 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  48.52 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  47.45 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  47.55 
 
 		 351 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  49.16 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  48.49 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.08 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.17 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.84 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.18 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.26 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  47.77 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.16 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.16 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.47 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.93 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  46.71 
 
 		 324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  48.03 
 
 		 326 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.53 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.16 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.65 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.65 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.98 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.2 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  43.43 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.51 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.85 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.95 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  44.91 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  45.4 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.65 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  45.31 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  45.1 
 
 		 335 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.21 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.2 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.85 
 
 		 322 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.75 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  44.1 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  46.6 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  45.51 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.2 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.08 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.3 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.4 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.87 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.15 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  44.26 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.02 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.01 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.67 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.42 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 331 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.11 
 
 		 331 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  46.67 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.79 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.11 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.82 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  48.51 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  44.41 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  45.2 
 
 		 334 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.52 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  44.04 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  44.41 
 
 		 326 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.82 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.83 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  48.16 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  44.14 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.62 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.62 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.38 
 
 		 326 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  45.03 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.44 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.15 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  44.73 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  44.88 
 
 		 305 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  42.72 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.28 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  43.79 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.2 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.38 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>