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for query gene RSP_0229 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.06 
 
 		 532 aa  1011    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  100 
 
 		 532 aa  1023    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.41 
 
 		 512 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  65.24 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  57.71 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.49 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.67 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.67 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.43 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.14 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.37 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.15 
 
 		 529 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.4 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.65 
 
 		 532 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.3 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.14 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.08 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.08 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 528 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 517 aa  349  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 525 aa  348  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.89 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.62 
 
 		 528 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.49 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 		 530 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  41.88 
 
 		 525 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.95 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  39.48 
 
 		 529 aa  333  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.27 
 
 		 526 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.02 
 
 		 543 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.58 
 
 		 524 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.77 
 
 		 524 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.71 
 
 		 523 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.3 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 		 526 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.6 
 
 		 524 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.6 
 
 		 524 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.4 
 
 		 524 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.55 
 
 		 530 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  42.6 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.92 
 
 		 523 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 524 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.58 
 
 		 516 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 		 535 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 		 542 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 535 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 542 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.22 
 
 		 543 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 542 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.59 
 
 		 542 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 		 535 aa  299  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.5 
 
 		 526 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  34.02 
 
 		 534 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.3 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.74 
 
 		 529 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.3 
 
 		 540 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.09 
 
 		 536 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.39 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 516 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 		 517 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  31.09 
 
 		 519 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 523 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  30.93 
 
 		 499 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 523 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 		 527 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 		 515 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 537 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 		 539 aa  233  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 535 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 537 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00460  transport protein  31.46 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 		 528 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 		 524 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 517 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
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NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.19 
 
 		 529 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
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