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for query gene PputGB1_1506 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.45 
 
 		 516 aa  1023    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.64 
 
 		 516 aa  1025    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.15 
 
 		 516 aa  939    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 516 aa  1036    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  84.48 
 
 		 519 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.05 
 
 		 517 aa  905    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  84.9 
 
 		 499 aa  851    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.31 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.81 
 
 		 526 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.51 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.31 
 
 		 542 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.86 
 
 		 542 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.86 
 
 		 542 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.31 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.12 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  53.73 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.81 
 
 		 538 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.17 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.29 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  53.4 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  48.75 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.27 
 
 		 539 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.06 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.66 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.79 
 
 		 529 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.31 
 
 		 540 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.11 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.68 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.52 
 
 		 523 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.29 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.67 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 514 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 		 516 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 		 523 aa  339  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  38.13 
 
 		 528 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  42.11 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 526 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 525 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 		 524 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 524 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 523 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 		 524 aa  333  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  37.35 
 
 		 508 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.37 
 
 		 524 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 528 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 530 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 		 532 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  36.67 
 
 		 525 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 		 525 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 		 525 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.32 
 
 		 523 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 531 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 		 522 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.55 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.35 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  35.56 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 		 535 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 528 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 511 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 529 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 532 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 529 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 528 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 		 532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 528 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.26 
 
 		 528 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 528 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 528 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 528 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.26 
 
 		 528 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 532 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.79 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 529 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 520 aa  297  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  37.24 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 532 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 511 aa  272  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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