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for query gene Mnod_7472 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.48 
 
 		 536 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.49 
 
 		 530 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 543 aa  1079    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  75 
 
 		 508 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.08 
 
 		 524 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.08 
 
 		 524 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.31 
 
 		 524 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.73 
 
 		 524 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.92 
 
 		 524 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.92 
 
 		 524 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.31 
 
 		 524 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.45 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.07 
 
 		 523 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  55 
 
 		 523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.54 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.93 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.93 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.96 
 
 		 525 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.31 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.44 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.2 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.4 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.16 
 
 		 530 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  46.14 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.88 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.74 
 
 		 529 aa  458  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.92 
 
 		 529 aa  458  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.2 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.8 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.97 
 
 		 532 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.97 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  44.29 
 
 		 525 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.5 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.55 
 
 		 529 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.82 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 511 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.86 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 517 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.64 
 
 		 512 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.16 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.12 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  43.68 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  36.87 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  36.87 
 
 		 499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 535 aa  320  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  35.48 
 
 		 539 aa  319  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  34.52 
 
 		 534 aa  319  7.999999999999999e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 516 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 542 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 542 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 516 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 542 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.67 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 543 aa  312  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  43.57 
 
 		 532 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.4 
 
 		 529 aa  310  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.19 
 
 		 532 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.36 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.45 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 539 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.63 
 
 		 526 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 		 536 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 519 aa  296  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.49 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.31 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  34.49 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 		 532 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.46 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 530 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 527 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 527 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 		 530 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 537 aa  257  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 		 532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 537 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 		 515 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00460  transport protein  33.4 
 
 		 528 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 		 521 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.76 
 
 		 529 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.21 
 
 		 523 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 527 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 517 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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