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for query gene PSPA7_2113 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 514 aa  1017    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.32 
 
 		 527 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.32 
 
 		 504 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  71.69 
 
 		 503 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.24 
 
 		 527 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.94 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.94 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.73 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.91 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.29 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.15 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.15 
 
 		 536 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.06 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.52 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.78 
 
 		 526 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 519 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.9 
 
 		 527 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.49 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.37 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 535 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.7 
 
 		 539 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  38.7 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.7 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.82 
 
 		 538 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.43 
 
 		 523 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  36.47 
 
 		 534 aa  362  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  38.87 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.86 
 
 		 516 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 524 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 523 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 529 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  35.01 
 
 		 528 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 516 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 		 535 aa  296  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 		 528 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 		 528 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 528 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 528 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 528 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 524 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 		 524 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 526 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 		 524 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 		 524 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 524 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.67 
 
 		 523 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 524 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.54 
 
 		 523 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 537 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 515 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.35 
 
 		 515 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.46 
 
 		 531 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 530 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  30.71 
 
 		 525 aa  256  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  33.27 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 		 528 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 525 aa  250  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 532 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  30.21 
 
 		 529 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 529 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 		 525 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  30.14 
 
 		 508 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 529 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 530 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.24 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.51 
 
 		 517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.35 
 
 		 515 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 		 528 aa  243  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
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NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 522 aa  240  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 524 aa  236  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.24 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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