More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2345 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.14 
 
 		 526 aa  823    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.56 
 
 		 524 aa  1023    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.56 
 
 		 524 aa  1024    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.75 
 
 		 524 aa  966    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 524 aa  1053    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.61 
 
 		 524 aa  1018    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  76.6 
 
 		 523 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  76.6 
 
 		 523 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.56 
 
 		 524 aa  1023    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.42 
 
 		 524 aa  1017    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.31 
 
 		 543 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.53 
 
 		 536 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  61.02 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.36 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.01 
 
 		 524 aa  458  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.45 
 
 		 532 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.4 
 
 		 531 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.36 
 
 		 522 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.76 
 
 		 528 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.49 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  43.82 
 
 		 529 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.01 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.2 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.09 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.17 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.01 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.5 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.7 
 
 		 529 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.39 
 
 		 528 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.97 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.7 
 
 		 530 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.01 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  43.41 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.09 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.23 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.51 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 		 511 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  36.19 
 
 		 519 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 		 517 aa  333  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.77 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.03 
 
 		 532 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  36.81 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 		 535 aa  321  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 535 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.66 
 
 		 539 aa  319  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 535 aa  319  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 526 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  34.74 
 
 		 534 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 526 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 543 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  38.28 
 
 		 539 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 		 512 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 523 aa  300  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 		 539 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 539 aa  294  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 527 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  38.37 
 
 		 532 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.45 
 
 		 532 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 		 527 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 504 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.9 
 
 		 510 aa  279  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.01 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 527 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 540 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 532 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  32.34 
 
 		 524 aa  256  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00460  transport protein  31.6 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31 
 
 		 515 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 515 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  32.73 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 523 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  33.83 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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