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for query gene Rmet_4652 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.66 
 
 
536 aa  862    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.98 
 
 
530 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  75 
 
 
543 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  100 
 
 
508 aa  1013    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.02 
 
 
524 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.63 
 
 
524 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.63 
 
 
524 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.63 
 
 
524 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.43 
 
 
524 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.24 
 
 
524 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.02 
 
 
524 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.48 
 
 
526 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.1 
 
 
523 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  55.71 
 
 
523 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
532 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.09 
 
 
524 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 
531 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.8 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.19 
 
 
528 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.79 
 
 
522 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  48.33 
 
 
529 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.64 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.93 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.09 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.64 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.08 
 
 
532 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.79 
 
 
528 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.08 
 
 
525 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.02 
 
 
528 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.08 
 
 
525 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.08 
 
 
532 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.37 
 
 
529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  45.63 
 
 
525 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.8 
 
 
529 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.92 
 
 
525 aa  421  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.75 
 
 
516 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.47 
 
 
516 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.96 
 
 
511 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 
517 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.2 
 
 
535 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
535 aa  349  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 
538 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
535 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  39.28 
 
 
539 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 
526 aa  343  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 
543 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 
542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 
542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.04 
 
 
529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 
542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 
542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  37.23 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
516 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.64 
 
 
535 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.39 
 
 
532 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 
516 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  37.05 
 
 
499 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 
516 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 
516 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 
517 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  36.31 
 
 
534 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 
526 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 
513 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 
523 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 
539 aa  309  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  44.34 
 
 
539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 
512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.81 
 
 
519 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 
529 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37 
 
 
536 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 
539 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 
540 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  42.47 
 
 
532 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.47 
 
 
532 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 
527 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 
516 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 
510 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 
532 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 
521 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
527 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.68 
 
 
527 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 
506 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.68 
 
 
527 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 
524 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 
515 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 
523 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.15 
 
 
529 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.12 
 
 
539 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 
539 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 
532 aa  256  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 
539 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
535 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.26 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.26 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.26 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 
530 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 
537 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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