More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3794 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.19 
 
 		 536 aa  808    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 530 aa  1060    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.49 
 
 		 543 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  75.98 
 
 		 508 aa  772    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.11 
 
 		 524 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.3 
 
 		 526 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.72 
 
 		 524 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.72 
 
 		 524 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.72 
 
 		 524 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 		 524 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 		 524 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.53 
 
 		 524 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.18 
 
 		 523 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  56.37 
 
 		 523 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.12 
 
 		 532 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.25 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.66 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.72 
 
 		 525 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.87 
 
 		 525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.23 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.87 
 
 		 525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  45.69 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.69 
 
 		 529 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.69 
 
 		 522 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.94 
 
 		 528 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.45 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  45.51 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.45 
 
 		 529 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.1 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.91 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.38 
 
 		 528 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.35 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.67 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.65 
 
 		 529 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.94 
 
 		 525 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.51 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 517 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  37.62 
 
 		 519 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  37.88 
 
 		 499 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 		 538 aa  330  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  35.73 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.09 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
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NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 		 517 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 		 535 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.09 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 516 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
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NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.83 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.89 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.16 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.49 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 542 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.56 
 
 		 513 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  42.6 
 
 		 539 aa  316  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 542 aa  316  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 542 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 542 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.76 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.78 
 
 		 529 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  40.43 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 		 536 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.89 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 519 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.53 
 
 		 540 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 539 aa  289  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 532 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 		 527 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 506 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 527 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 527 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 		 527 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 		 526 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 		 537 aa  259  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 521 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.5 
 
 		 517 aa  256  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.87 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 524 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 527 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
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NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 504 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 520 aa  240  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 		 530 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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