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for query gene Swit_4512 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 523 aa  1032    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  64.54 
 
 		 511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.7 
 
 		 532 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  55.95 
 
 		 528 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.27 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  50.2 
 
 		 524 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.35 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.54 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.87 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.87 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.87 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.39 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.54 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.05 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.6 
 
 		 535 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.79 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  39.63 
 
 		 534 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  39.76 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 		 516 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.12 
 
 		 516 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 		 516 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  39.8 
 
 		 499 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 536 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 517 aa  339  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 		 539 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 529 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.4 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 		 539 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.3 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.41 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.15 
 
 		 535 aa  316  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 		 542 aa  315  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.35 
 
 		 542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.07 
 
 		 529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 		 527 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 		 527 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.96 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 504 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 538 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 		 530 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 		 526 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 		 530 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 		 528 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 532 aa  297  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 		 515 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 		 525 aa  293  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 525 aa  293  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 525 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 515 aa  289  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 520 aa  289  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 517 aa  286  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  33.84 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 521 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 		 537 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 		 524 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 515 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 532 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 		 525 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.02 
 
 		 532 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 526 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 529 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 522 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  35.85 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 		 523 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.72 
 
 		 523 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  30.78 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 529 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 		 519 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  34.07 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
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NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 524 aa  253  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.46 
 
 		 524 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 524 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 530 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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