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for query gene PP_2067 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 527 aa  1048    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.4 
 
 		 504 aa  988    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.32 
 
 		 514 aa  711    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  72.07 
 
 		 503 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.56 
 
 		 527 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.17 
 
 		 527 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.17 
 
 		 527 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.75 
 
 		 530 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.23 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.81 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.1 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 		 526 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.95 
 
 		 536 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.24 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.2 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.99 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  38.75 
 
 		 534 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  41.75 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 		 516 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.15 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.15 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.11 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.71 
 
 		 542 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.71 
 
 		 542 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  41.07 
 
 		 539 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.65 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  41.36 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.52 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.78 
 
 		 526 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.52 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.39 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.77 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.87 
 
 		 529 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 		 524 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 		 528 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 529 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 524 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 		 535 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.13 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.13 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 524 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 		 523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 524 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.05 
 
 		 523 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 526 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 516 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  33.2 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.93 
 
 		 529 aa  276  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.73 
 
 		 529 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.8 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 531 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 537 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 526 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  31.92 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.72 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  31.41 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  33.2 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 515 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 532 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 524 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 511 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  31.62 
 
 		 508 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 525 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 525 aa  250  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 517 aa  250  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.66 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.71 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 529 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.02 
 
 		 530 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 506 aa  240  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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