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for query gene Bcenmc03_3627 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.54 
 
 		 529 aa  939    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.02 
 
 		 528 aa  968    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.93 
 
 		 535 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 528 aa  1050    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  70.16 
 
 		 524 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 528 aa  1050    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 528 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.08 
 
 		 528 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.27 
 
 		 528 aa  957    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  52.95 
 
 		 528 aa  528  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.98 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.07 
 
 		 523 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.72 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  49.8 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.87 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.66 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.13 
 
 		 529 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.85 
 
 		 527 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  38.66 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  35.1 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 536 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.83 
 
 		 539 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  38.52 
 
 		 499 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 517 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.94 
 
 		 516 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 		 540 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.89 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 542 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.57 
 
 		 542 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 535 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.57 
 
 		 542 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 542 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.93 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.94 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.4 
 
 		 529 aa  319  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 527 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 		 538 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 543 aa  312  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 521 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 527 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 		 515 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 530 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.84 
 
 		 528 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 514 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 528 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 537 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 520 aa  292  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 515 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.52 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.59 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  33.2 
 
 		 529 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.52 
 
 		 529 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.56 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 524 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 525 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 525 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 529 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 525 aa  266  8.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 		 532 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  31.05 
 
 		 525 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 		 532 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 529 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.61 
 
 		 522 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.74 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  34.7 
 
 		 503 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 		 517 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.14 
 
 		 532 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 516 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.42 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.02 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.2 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 537 aa  248  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 519 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
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