More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2258 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 516 aa  1033    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.7 
 
 		 532 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.73 
 
 		 532 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.68 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.1 
 
 		 529 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.51 
 
 		 532 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.1 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.81 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.3 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.89 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.3 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.89 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  46.57 
 
 		 525 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.68 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.71 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.16 
 
 		 525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.41 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.41 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.58 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.38 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.81 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  45.75 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  45.91 
 
 		 529 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.63 
 
 		 536 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.82 
 
 		 543 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.73 
 
 		 511 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.51 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.91 
 
 		 526 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.51 
 
 		 524 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.51 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.11 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.11 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.51 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.51 
 
 		 524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.49 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.01 
 
 		 524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.14 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  39.22 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  39.32 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 516 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.31 
 
 		 542 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.31 
 
 		 542 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.31 
 
 		 542 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 		 516 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 		 526 aa  335  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 		 542 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 		 512 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 513 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.99 
 
 		 539 aa  324  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 526 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.19 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  38.67 
 
 		 539 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 539 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 539 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.01 
 
 		 540 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  34.67 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.02 
 
 		 510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 536 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 519 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 537 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 		 521 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 517 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.34 
 
 		 532 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  38.58 
 
 		 532 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 532 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.65 
 
 		 516 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 		 527 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 515 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 535 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 		 528 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00460  transport protein  32.41 
 
 		 528 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 537 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
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NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 		 523 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 528 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 		 539 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
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