More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1944 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  68.69 
 
 		 605 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  85.83 
 
 		 627 aa  991    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.56 
 
 		 587 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  73.78 
 
 		 612 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 607 aa  1217    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.92 
 
 		 614 aa  800    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.87 
 
 		 610 aa  884    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 646 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 643 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  44.75 
 
 		 648 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 606 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 630 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 		 605 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.46 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  45.65 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.44 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  37.97 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  36.03 
 
 		 599 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 614 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  37.76 
 
 		 609 aa  256  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 548 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 484 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 661 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 579 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1350 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 617 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 713 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 911 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  45.16 
 
 		 783 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 763 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  45.16 
 
 		 783 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 523 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1596 aa  200  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 973 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  41.22 
 
 		 773 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 769 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 969 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 844 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 774 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 984 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 784 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 770 aa  196  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 371 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  42.22 
 
 		 288 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 1255 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  42.02 
 
 		 771 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 		 708 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  41.36 
 
 		 1135 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.73 
 
 		 882 aa  193  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 1126 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 676 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 1192 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1255 aa  193  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 1131 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 832 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 775 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  43.33 
 
 		 565 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 377 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  43.43 
 
 		 576 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 1611 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 568 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 977 aa  190  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 717 aa  190  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 969 aa  190  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 772 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1326 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  41.67 
 
 		 774 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 745 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 620 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 778 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 882 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 738 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1352 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  41.25 
 
 		 771 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  42.75 
 
 		 790 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1064 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 997 aa  187  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1287 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1069 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 775 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 957 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 1046 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1009 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 505 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 911 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 731 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1611 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1068 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 686 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 1276 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  36.14 
 
 		 1119 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>