More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3309 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  95.87 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  95.04 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  96.69 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  95.87 
 
 		 121 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  95.87 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  93.39 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  79.34 
 
 		 126 aa  205  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  79.34 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  80.17 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  80.17 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  79.34 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  78.51 
 
 		 124 aa  199  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 123 aa  196  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  74.38 
 
 		 134 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  74.38 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  75.21 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  75 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 127 aa  186  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  70.25 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  66.67 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  47.93 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 		 1274 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1352 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  43.97 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  42.02 
 
 		 1060 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  48.54 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  40 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1271 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1070 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 397 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.83 
 
 		 763 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1977 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  42.98 
 
 		 248 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1078 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  43.22 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 		 497 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1172 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 964 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1044 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 1160 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1245 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  42.86 
 
 		 666 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.17 
 
 		 1331 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  40.34 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  40 
 
 		 1297 aa  94  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 956 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1284 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  38.6 
 
 		 742 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.66 
 
 		 1765 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  40.87 
 
 		 732 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1771 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1333 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 778 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1767 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1767 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 993 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 1287 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.83 
 
 		 227 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 125 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 869 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1767 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1050 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>