More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1686 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3588  thiolase  89.42 
 
 		 379 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  100 
 
 		 379 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  89.68 
 
 		 379 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  89.15 
 
 		 379 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  87.83 
 
 		 379 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  75.4 
 
 		 380 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  71.62 
 
 		 380 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  60.16 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  41.79 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  44.53 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  42.03 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.23 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  40.36 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.76 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  42.04 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.83 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.13 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  43.35 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  38.7 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  39.27 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.09 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  41.99 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.79 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.05 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.63 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  40.63 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  40.57 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  42.82 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.04 
 
 		 385 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  42.11 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  41.3 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  40.26 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  40.78 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  40.11 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  40.68 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  39.83 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.82 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  39.08 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  39.74 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.7 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 		 385 aa  212  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  40.11 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  40.96 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  39.17 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.82 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  37.91 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.89 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.63 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  32.79 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.58 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.96 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.98 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.63 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.23 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.07 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.88 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.68 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.97 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.44 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  31.47 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.34 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  32.31 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.99 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  31.92 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.59 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  32.13 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  29.82 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.56 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  32.11 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.67 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.76 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.33 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.4 
 
 		 392 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  32.23 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.18 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  32.23 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  32.23 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  29.44 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.17 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  28.76 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  27.98 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.82 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.61 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  33.51 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  31.73 
 
 		 396 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.29 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.51 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.01 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  29.9 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  29.75 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  31.15 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>