More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1330 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 260 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  76.92 
 
 		 260 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  76.83 
 
 		 260 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  76.83 
 
 		 260 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  70.16 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  49.43 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  49.05 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  47.92 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  48.48 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  45.08 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  47.17 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  44.15 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  45.32 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  41.57 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.32 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.74 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.74 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.74 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.41 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.41 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.41 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 421 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 306 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  30.13 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.24 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.49 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  28.83 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.76 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.39 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32 
 
 		 372 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 390 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  27 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.97 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  29.34 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>