More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1567 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.14 
 
 		 152 aa  206  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  69.33 
 
 		 152 aa  201  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  46.97 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  46.97 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  42.86 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.55 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.5 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  41.78 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  40.97 
 
 		 145 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.28 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  43.06 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.18 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  43.06 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  41.78 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  38.85 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  38.85 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  38.85 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  42.18 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  42.18 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.16 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  42.65 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  44.7 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  44.7 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  41.5 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  43.38 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  43.38 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  39.58 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  41.06 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  40.41 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.41 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  40.85 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  38.19 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  40.29 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  38.85 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.06 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  40.15 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  38.85 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.32 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.14 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  37.8 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  41.67 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  38.93 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  38.81 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  38.52 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  39.86 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  39.72 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  35.97 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  39.23 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.3 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  39.42 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  39.23 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  37.04 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  37.04 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  41.73 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  39.19 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  38.46 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  34.75 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.23 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  39.31 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  36.92 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  36.92 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  35.71 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  38.46 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  36.22 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  39.85 
 
 		 173 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  36.57 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  36.15 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1066  TolR protein  35.81 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  36.69 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  36.3 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>