More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3280 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.43 
 
 
638 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.78 
 
 
638 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.78 
 
 
638 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.78 
 
 
638 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  69.23 
 
 
640 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.28 
 
 
640 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  74.48 
 
 
638 aa  358  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  68.53 
 
 
629 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  71.23 
 
 
638 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.58 
 
 
639 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.58 
 
 
639 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.23 
 
 
639 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.88 
 
 
639 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  66.08 
 
 
633 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  71.23 
 
 
638 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  69.58 
 
 
647 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  69.58 
 
 
647 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  67.83 
 
 
640 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  66.43 
 
 
619 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  65.73 
 
 
640 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  65.03 
 
 
647 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  67.83 
 
 
639 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.19 
 
 
639 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  64.34 
 
 
647 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.6 
 
 
739 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.25 
 
 
647 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.25 
 
 
647 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  58.04 
 
 
642 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.04 
 
 
650 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  57.69 
 
 
676 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  58.04 
 
 
681 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  57.34 
 
 
642 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.3 
 
 
647 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  54.2 
 
 
626 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 
634 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  52.45 
 
 
652 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 
654 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.4 
 
 
543 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
541 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.35 
 
 
655 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
541 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
541 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
541 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
425 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  46.32 
 
 
541 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
541 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  46.45 
 
 
712 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.91 
 
 
541 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  46.1 
 
 
712 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 
646 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
716 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
541 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
541 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
713 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
541 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
541 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
541 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
541 aa  208  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  44.76 
 
 
541 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
541 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.48 
 
 
679 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
541 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.58 
 
 
636 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.55 
 
 
523 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
632 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.25 
 
 
637 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
522 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  43.36 
 
 
551 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
544 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
637 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
674 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
541 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 
546 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  43.36 
 
 
550 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
714 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
570 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 
540 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 
540 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
540 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
546 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
552 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
555 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 
552 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  44.21 
 
 
541 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  44.21 
 
 
541 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
638 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
624 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
541 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.66 
 
 
605 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.34 
 
 
544 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  41.26 
 
 
546 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
646 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
646 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
646 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
539 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
541 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.94 
 
 
544 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
541 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
541 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>