More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1462 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  100 
 
 		 339 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  68.45 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  58.92 
 
 		 341 aa  361  8e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  54.14 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  56.51 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  56.51 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  52.45 
 
 		 348 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  55.62 
 
 		 338 aa  319  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  51.56 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  53.07 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  49.7 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  53.09 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  44.51 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  46.45 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  45.86 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  44.02 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  46.45 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.2 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  46.98 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  48.97 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  46.63 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  44.84 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  46.86 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  46.73 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  46.27 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  48.61 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  44.65 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  50.3 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.14 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  42.56 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  45.71 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  43.65 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  46.71 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  39.53 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.79 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  44.65 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  44.34 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  48.28 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  38.63 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.67 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.41 
 
 		 362 aa  225  9e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  42.99 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  38.1 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  41.27 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  39.88 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.11 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  43.35 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  45.52 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.18 
 
 		 347 aa  218  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  44.48 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  39.1 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.18 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  42.7 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  40.89 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  46.26 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  44.31 
 
 		 358 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  46.93 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  43.55 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  38.42 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  42.9 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  36.71 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  38.24 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  41.98 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  36.39 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  40.32 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  37.61 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.32 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.26 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  41.01 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  45.22 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.06 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  39.71 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  42.96 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  34.48 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  45.93 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  33.53 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.73 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  39.01 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.62 
 
 		 383 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.43 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.08 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.26 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.38 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  41.08 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  36.43 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.35 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  34.48 
 
 		 331 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  38.32 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.69 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.11 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.93 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.94 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.46 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  42.51 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.29 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>