159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0737 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 
341 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  65.5 
 
 
344 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  61 
 
 
341 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  63.53 
 
 
340 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  65.2 
 
 
351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  62.02 
 
 
342 aa  434  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  63.64 
 
 
342 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  61.72 
 
 
343 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  57.23 
 
 
376 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  55.07 
 
 
344 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  54.09 
 
 
356 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  52.03 
 
 
350 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  52.37 
 
 
343 aa  345  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  52.37 
 
 
343 aa  345  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  50.58 
 
 
341 aa  334  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  48.83 
 
 
357 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  47.81 
 
 
345 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  47.81 
 
 
345 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  48.09 
 
 
367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  49.42 
 
 
355 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  47.23 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  46.94 
 
 
363 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  44.81 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  47.66 
 
 
345 aa  301  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  47.81 
 
 
386 aa  296  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  48.35 
 
 
328 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  46.96 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.86 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  41.79 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.17 
 
 
322 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.81 
 
 
322 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.27 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.86 
 
 
325 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.55 
 
 
325 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  39.76 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.63 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  38.69 
 
 
349 aa  238  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  39.53 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  37.35 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  39.23 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  38.79 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  40 
 
 
352 aa  232  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  38.64 
 
 
639 aa  229  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  38.26 
 
 
348 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  38.42 
 
 
334 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  37.5 
 
 
346 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  37.32 
 
 
349 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  38.82 
 
 
354 aa  222  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  37.43 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.54 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  34.02 
 
 
339 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.89 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  38.42 
 
 
640 aa  215  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  38.17 
 
 
334 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  36.47 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  35.71 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  36.13 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  35.86 
 
 
349 aa  212  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  39.54 
 
 
348 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  37.17 
 
 
348 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  37.76 
 
 
348 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  35.19 
 
 
352 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  38.42 
 
 
624 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.12 
 
 
349 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.1 
 
 
631 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  36.47 
 
 
358 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  36.29 
 
 
343 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  33.63 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  34.72 
 
 
346 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  33.04 
 
 
347 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  34.26 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  31.21 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  33.24 
 
 
370 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  31.75 
 
 
369 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  31.2 
 
 
364 aa  176  6e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  36.26 
 
 
332 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  31.37 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  32.21 
 
 
370 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  31.27 
 
 
371 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  31.27 
 
 
371 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  31.27 
 
 
365 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  30.45 
 
 
370 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  31.28 
 
 
370 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  34.96 
 
 
345 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  30.64 
 
 
370 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  30.73 
 
 
368 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  31.28 
 
 
368 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  30.92 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  31.11 
 
 
370 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  31.3 
 
 
368 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  30.28 
 
 
371 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  30.83 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  30.83 
 
 
370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  31.01 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  30.36 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  34.67 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  32.66 
 
 
350 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  32.24 
 
 
370 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  30.83 
 
 
370 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  32.27 
 
 
364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>