More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4004 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  100 
 
 
639 aa  1309    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  33.46 
 
 
350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.69 
 
 
337 aa  127  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  28.37 
 
 
366 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.88 
 
 
356 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  33.33 
 
 
347 aa  124  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04250  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.12 
 
 
349 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.25 
 
 
354 aa  123  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  31.56 
 
 
405 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  31.7 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 
330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 
330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 
330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 
330 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  30.25 
 
 
318 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 
330 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  30.25 
 
 
318 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  28.66 
 
 
402 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  31.95 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  32.1 
 
 
361 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.36 
 
 
930 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  30.47 
 
 
359 aa  120  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
330 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  29.04 
 
 
324 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  32.08 
 
 
353 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  29.23 
 
 
343 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 
330 aa  120  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  29.41 
 
 
330 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 
333 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  31.53 
 
 
367 aa  120  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.3 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.24 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  31.6 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  32.6 
 
 
347 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  30.89 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  28.2 
 
 
331 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  28.21 
 
 
369 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  30.77 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  28.2 
 
 
331 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  33.33 
 
 
387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.54 
 
 
360 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  33.96 
 
 
342 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  29.39 
 
 
328 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  33.48 
 
 
348 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.73 
 
 
377 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
359 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.81 
 
 
360 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
331 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.88 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.67 
 
 
349 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.49 
 
 
378 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.25 
 
 
378 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.25 
 
 
378 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.25 
 
 
378 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  27.85 
 
 
350 aa  118  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.25 
 
 
378 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  27.46 
 
 
348 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  28.93 
 
 
333 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2121  ABC transporter related  32.81 
 
 
316 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.67463 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  27.82 
 
 
362 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  30.4 
 
 
373 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
331 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.44 
 
 
327 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
333 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 
378 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 
353 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.8 
 
 
358 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  28.52 
 
 
348 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  30.43 
 
 
357 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  31.16 
 
 
356 aa  117  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1935  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.56 
 
 
357 aa  117  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  29.18 
 
 
367 aa  117  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  32.08 
 
 
368 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  29.23 
 
 
348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  29.35 
 
 
381 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  29.21 
 
 
331 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.2 
 
 
327 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  29.23 
 
 
348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  31.78 
 
 
356 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32 
 
 
370 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.88 
 
 
378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.88 
 
 
378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  32.3 
 
 
386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.88 
 
 
378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  30.64 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  30.28 
 
 
338 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  29.23 
 
 
348 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  32.43 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  32.35 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  28 
 
 
352 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  27.8 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  35.71 
 
 
356 aa  115  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>