76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0098 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.74 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.66 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  46.35 
 
 		 238 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.27 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  41.78 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  38.26 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  40.96 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  31.38 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.94 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  26.6 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.22 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.77 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.22 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.61 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.13 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.31 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  29.18 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  28.82 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  46.94 
 
 		 139 aa  86.3  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  28.63 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  41.88 
 
 		 114 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.03 
 
 		 1031 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.66 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  28.42 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.83 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  27.67 
 
 		 173 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  25.97 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  27.07 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.08 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.12 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  32.35 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.15 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.74 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.53 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.03 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.04 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.01 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.58 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  42.86 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.84 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.77 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.26 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.38 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.75 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.81 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.03 
 
 		 570 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.64 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  27.19 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  38.81 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  33.67 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.67 
 
 		 550 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  34 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  24.25 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.72 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  24.86 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  28.09 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.67 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.03 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.7 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  32.79 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.13 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  33.68 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.29 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.52 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  29.34 
 
 		 553 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.47 
 
 		 731 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.45 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.45 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>