More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0014 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  51.67 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  56.58 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  48.26 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  52.53 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  49.71 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  45.13 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  48.73 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  48.1 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  45.03 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  45.03 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  44.83 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  43.65 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  47.74 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  45.96 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  38.83 
 
 		 291 aa  154  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  42.35 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  39.39 
 
 		 287 aa  151  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  51.15 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  40.82 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  40.72 
 
 		 286 aa  151  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  51.08 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  45.29 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  45.29 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  46.29 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  42.33 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  45.66 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  46.25 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  44.94 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  44.85 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 		 200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  39.3 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  39 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  48.95 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  44.19 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  41.24 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  42.5 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  44.72 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  42.58 
 
 		 231 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  42.58 
 
 		 231 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  41.45 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  45.27 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  42.41 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  42.95 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  41.4 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  42.67 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  48.18 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.96 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  45.27 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  45.27 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  37.97 
 
 		 205 aa  130  9e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  39.46 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  43.92 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  45.1 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  42 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.83 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  36.75 
 
 		 171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.86 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  38.56 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  43.79 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  45.27 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  43.79 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  35.64 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.33 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  35.79 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  38.83 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.77 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  40.67 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  37.71 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  43.67 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  30.35 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.82 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  36.23 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>