More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1773 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  57.26 
 
 
127 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
129 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  49.61 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  52.85 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  53.7 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  53.7 
 
 
147 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  61.54 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
167 aa  117  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  61.11 
 
 
163 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  58.89 
 
 
140 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  62.22 
 
 
170 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  43.55 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  45.9 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  51.04 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
163 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
124 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
150 aa  110  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
124 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
127 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
322 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
246 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
114 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
281 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  48.36 
 
 
214 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
124 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
165 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
199 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  54.17 
 
 
263 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
358 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
324 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  44.35 
 
 
249 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
342 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
139 aa  103  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
339 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50 
 
 
267 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  48.28 
 
 
128 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  49.53 
 
 
213 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  53.93 
 
 
257 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  52.13 
 
 
125 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  50 
 
 
267 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  52.75 
 
 
125 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  50.52 
 
 
297 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50.96 
 
 
259 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  49.09 
 
 
162 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50 
 
 
243 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  48.62 
 
 
133 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
270 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
186 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
163 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  51 
 
 
259 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  47.87 
 
 
144 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  49.07 
 
 
121 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
371 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
221 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
179 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
196 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
239 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
166 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
335 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  50 
 
 
265 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
321 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  44.74 
 
 
324 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.3 
 
 
285 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  46.74 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
249 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
238 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
242 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  42.59 
 
 
202 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  43.52 
 
 
230 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
242 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  49.46 
 
 
342 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
230 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
408 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
282 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  43.52 
 
 
211 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  43.52 
 
 
211 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  43.52 
 
 
211 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  48.39 
 
 
211 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
265 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
203 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  48.54 
 
 
297 aa  97.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
322 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  48.39 
 
 
341 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>