More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0046 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  100 
 
 
120 aa  246  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  97.54 
 
 
122 aa  238  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  63.46 
 
 
120 aa  147  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  67.11 
 
 
124 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  64.47 
 
 
124 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  64.47 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  53.92 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
211 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  64.47 
 
 
124 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  51.43 
 
 
358 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
211 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
230 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
242 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
242 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
211 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
230 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  63.16 
 
 
155 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  52.48 
 
 
211 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  60.76 
 
 
181 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  52.48 
 
 
125 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
163 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  57.5 
 
 
122 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  59.21 
 
 
122 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.68 
 
 
125 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  55.42 
 
 
200 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  50 
 
 
203 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
163 aa  104  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  55.95 
 
 
168 aa  104  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  50 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
203 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
214 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
203 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  50 
 
 
213 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  59.21 
 
 
171 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  64.47 
 
 
324 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  48.51 
 
 
200 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  63.01 
 
 
199 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  64.38 
 
 
199 aa  103  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  48.42 
 
 
171 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
360 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
165 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
150 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
360 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  49.5 
 
 
202 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  61.04 
 
 
198 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
266 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  50 
 
 
239 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  50 
 
 
270 aa  101  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.13 
 
 
163 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  56.96 
 
 
122 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
170 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
127 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.23 
 
 
342 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  47.06 
 
 
261 aa  100  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
121 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  42.48 
 
 
270 aa  100  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
285 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  60.27 
 
 
239 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  44.79 
 
 
286 aa  99.4  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  56.58 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  58.9 
 
 
335 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
145 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  51.14 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  60.27 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  60.27 
 
 
144 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
133 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  64.47 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  50 
 
 
371 aa  98.2  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  56.96 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  58.44 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  50.57 
 
 
249 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  46.74 
 
 
253 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  60.26 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  40.71 
 
 
264 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  58.23 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  60.76 
 
 
168 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  46.81 
 
 
275 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  47.25 
 
 
266 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  49.43 
 
 
323 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  42.72 
 
 
331 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  46.81 
 
 
275 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
221 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  56.16 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55.26 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  47.87 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  55 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  57.53 
 
 
213 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  56.58 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>