More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2965 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  100 
 
 		 433 aa  897    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  46.19 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  45.15 
 
 		 433 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  45.39 
 
 		 448 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  46.53 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  44.14 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  44.83 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  44.34 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  42.72 
 
 		 448 aa  342  8e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  39.77 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  37.44 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  34.17 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  33.88 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 456 aa  221  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  30.68 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  29.79 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  30.48 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  30.24 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  29.55 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  31.14 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  31.83 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  31.36 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  38.96 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  38.31 
 
 		 244 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  37.74 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.95 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  47.96 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.91 
 
 		 306 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.82 
 
 		 312 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  37.97 
 
 		 285 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.94 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.87 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  41.9 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  32.74 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.48 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  45.45 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  43.88 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  39.26 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  40 
 
 		 275 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  33.95 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  39.26 
 
 		 319 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  38.57 
 
 		 318 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.93 
 
 		 268 aa  94.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  40 
 
 		 275 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  36.88 
 
 		 285 aa  93.6  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  33.93 
 
 		 269 aa  93.6  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  38.3 
 
 		 294 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  40 
 
 		 275 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.6 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  38.71 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  43.75 
 
 		 313 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  44.9 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.44 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40.2 
 
 		 309 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  39.86 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  40 
 
 		 274 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  44.55 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38.61 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  37.59 
 
 		 238 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.9 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.88 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  41.67 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  45.92 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  38.06 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  45.36 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  38.1 
 
 		 273 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  37.62 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.86 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  38.1 
 
 		 274 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  46.81 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  40.59 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.86 
 
 		 445 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  41.24 
 
 		 541 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  38.85 
 
 		 263 aa  87  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.41 
 
 		 300 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.07 
 
 		 321 aa  86.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.3 
 
 		 293 aa  86.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  39.81 
 
 		 284 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  38.79 
 
 		 328 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  38.98 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.84 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  39.8 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.29 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.29 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  38.3 
 
 		 141 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  32.12 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  35.14 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.29 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.84 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.62 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  34.78 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  42.27 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  32.12 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  40.82 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.86 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  40.82 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>