More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0419 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
405 aa  836    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  57.86 
 
 
412 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  55 
 
 
406 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  53.63 
 
 
429 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  34.21 
 
 
362 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
465 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  32.73 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 
370 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
361 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.9 
 
 
313 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 
323 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.18 
 
 
373 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
415 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
421 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
335 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.29 
 
 
431 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.08 
 
 
328 aa  142  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.6 
 
 
395 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  32.02 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
385 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
379 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
418 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
418 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  31.64 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 
671 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
368 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.01 
 
 
357 aa  133  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 
393 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
662 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
434 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 
334 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  30.02 
 
 
402 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.87 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 
468 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
652 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
415 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 
362 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.12 
 
 
362 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 
313 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
632 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
318 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  38.1 
 
 
406 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
395 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
320 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.48 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
686 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
698 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.71 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.79 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.78 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 
689 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 
389 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
386 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
313 aa  116  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
375 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.92 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 
437 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.2 
 
 
387 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
418 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.16 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  30.73 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
399 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
438 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
419 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
414 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  29.07 
 
 
349 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.03 
 
 
450 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.93 
 
 
328 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.57 
 
 
338 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
340 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
361 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.62 
 
 
312 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  28.84 
 
 
365 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 
324 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
371 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.5 
 
 
468 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
365 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>