124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3923 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  38.94 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  41.75 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  41.63 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  44.06 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  42.78 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  44.74 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  43.65 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  43 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  40.91 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  40.91 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  41.01 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  40.4 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  39.9 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  43.68 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  43.69 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  42.86 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  40 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  36.55 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  38.92 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  37.13 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  34.12 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  33.8 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  35.08 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  36.73 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  37.24 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  34.86 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  34.67 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  34.97 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  31.25 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35.38 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  35.14 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.03 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.57 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.94 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  26.57 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  35.04 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.03 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.46 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  34.71 
 
 		 377 aa  62  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.09 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.11 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.11 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.11 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  32.11 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  33.33 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  33.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  33.33 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  30.56 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.06 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  27.65 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  25.47 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  31.11 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  29.66 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.47 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  29.66 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  30.15 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  27.13 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.51 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  28.66 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25.39 
 
 		 312 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  26.11 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  31.11 
 
 		 320 aa  52.4  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.03 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  26.11 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  23.11 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  23.11 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.11 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.35 
 
 		 521 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  28.85 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.11 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  37.23 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.91 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.93 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.37 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  32.69 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  31.82 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  32.35 
 
 		 556 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  31.15 
 
 		 377 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  31.58 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.67 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.67 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  33.06 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  31.9 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.37 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  32.76 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.67 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  29.82 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  30.65 
 
 		 339 aa  49.3  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.69 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  33.61 
 
 		 324 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  29.75 
 
 		 273 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  33.94 
 
 		 381 aa  48.9  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  29.81 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  28.95 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  28.46 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  29.75 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  31.4 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>