165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04321 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  81.23 
 
 		 429 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  100 
 
 		 407 aa  800    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  78.73 
 
 		 429 aa  628  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  78.48 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  49.64 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  48.18 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  48.38 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  50.51 
 
 		 1140 aa  355  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.15 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  43.66 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  45.86 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  43.77 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  46.52 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  42.34 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  46.1 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.87 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.33 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  42.34 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.2 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  42.72 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  44.31 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 452 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 452 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  42.59 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  40.81 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  40.81 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  40.81 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  40.81 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  40 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  40.28 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  40.1 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  40.1 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  38.35 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  37.95 
 
 		 433 aa  265  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  38.68 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  37.74 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.76 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  35.82 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  35.37 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.75 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 		 423 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  36.5 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.51 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  34.07 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  33 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  32.26 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  32.26 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  33.74 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.45 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  33.33 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.25 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  30.22 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.31 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  33.66 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.31 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.77 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  31.22 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  30.92 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.43 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.88 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.09 
 
 		 431 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  33.89 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.37 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.25 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33.42 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  30.5 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.16 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.19 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.51 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.84 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.68 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.11 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  32.2 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  29.85 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.81 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.05 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  30.45 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.65 
 
 		 436 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  29.1 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  31.72 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  31.75 
 
 		 433 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  31.14 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  27.27 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  28.22 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  29.11 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.86 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.84 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.84 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  29.93 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  28.84 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>