211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5398 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  100 
 
 
218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  98.16 
 
 
235 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  65.9 
 
 
219 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  65.09 
 
 
219 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  66.05 
 
 
219 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  65.57 
 
 
219 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  70.51 
 
 
219 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  65.35 
 
 
219 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  39.13 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  34 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  34.33 
 
 
220 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  33 
 
 
207 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  34.3 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  34.8 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  33 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 
206 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  33 
 
 
207 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  31.5 
 
 
207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  34.09 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  32.68 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  31.98 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  33.82 
 
 
205 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  35.38 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  37.28 
 
 
229 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 
208 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  33.85 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  38.58 
 
 
460 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  30.95 
 
 
209 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 
220 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 
221 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 
221 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  33.68 
 
 
220 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 
216 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
210 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  38.97 
 
 
213 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  30.85 
 
 
215 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 
423 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  34.83 
 
 
210 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 
252 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  32.66 
 
 
215 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  29.63 
 
 
402 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
211 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  29.67 
 
 
419 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  34.16 
 
 
221 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  30.2 
 
 
211 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  30.57 
 
 
221 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 
208 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 
245 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  32.34 
 
 
249 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  30.15 
 
 
211 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  32.56 
 
 
259 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  32.09 
 
 
259 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  32.52 
 
 
198 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  31.84 
 
 
212 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  32.65 
 
 
292 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  32.92 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  32.83 
 
 
213 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  28.5 
 
 
449 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  32.32 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  31.5 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  29.03 
 
 
422 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  28.72 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  32.92 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  34.83 
 
 
449 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  28.28 
 
 
444 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  29.13 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  30.26 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  29.27 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  32.52 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  31.55 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  29.57 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  29.57 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  32.64 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.1 
 
 
426 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  29.49 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  30.09 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  34.34 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  29.63 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  29.03 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  27.72 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  27.27 
 
 
405 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  30.77 
 
 
464 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  29.7 
 
 
423 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 
205 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  26.5 
 
 
324 aa  91.7  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>