245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34229 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34229  predicted protein  100 
 
 		 497 aa  1030    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3824  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.96 
 
 		 331 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2169  tRNA-dihydrouridine synthase A  34.33 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1996  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.98 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00283528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3573  tRNA-dihydrouridine synthase A  34.07 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32690  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.56 
 
 		 336 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2209  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.46 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_4127  predicted protein  31.62 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0511139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1710  tRNA-dihydrouridine synthase A  34.88 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262084  hitchhiker  0.0000258631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2362  tRNA-dihydrouridine synthase A  34.98 
 
 		 334 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1933  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.7 
 
 		 331 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1686  tRNA-dihydrouridine synthase A  35.18 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.902127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1275  TIM-barrel protein, yjbN family  32.57 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27980  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.96 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1664  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.08 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000128148  normal  0.374359 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4136  predicted protein  32.82 
 
 		 355 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410794  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2504  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.46 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0964  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.44 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.946699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1088  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.46 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0247778  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1568  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.46 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1641  YjbN family TIM-barrel protein  33.46 
 
 		 333 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3764  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.08 
 
 		 337 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0852  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.18 
 
 		 326 aa  116  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00194656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0271  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.03 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2126  TIM-barrel protein, yjbN family  33.96 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2084  YjbN family TIM-barrel protein  32.57 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4710  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.72 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2388  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.4 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0913736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1621  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.28 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1200  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.2 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1469  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.72 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0655175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2485  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.82 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0461932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0353  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.13 
 
 		 335 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2138  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.59 
 
 		 329 aa  113  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386307  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1755  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.72 
 
 		 333 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4203  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.73 
 
 		 331 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  hitchhiker  0.0000157643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1936  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.33 
 
 		 339 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.564844  normal  0.370687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2513  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.34 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0954  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.98 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.278842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1210  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.47 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1918  tRNA-dihydrouridine synthase A  33.07 
 
 		 337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3858  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.43 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.606559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3768  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.43 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0342363  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5568  hypothetical protein  32.68 
 
 		 341 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1302  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.43 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2960  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.8 
 
 		 337 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2153  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.87 
 
 		 344 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1916  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.35 
 
 		 352 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648833  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0536  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.96 
 
 		 329 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00246353  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1669  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.11 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2494  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.01 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.38061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03597  tRNA-dihydrouridine synthase A  28.78 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.263029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1943  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.18 
 
 		 331 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1549  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.54 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.28952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0909  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.03 
 
 		 340 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1299  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.01 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0487705  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2364  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.15 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3570  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.34 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1729  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.42 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000628282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1420  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.8 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0744  TIM-barrel protein, yjbN family  32.13 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1235  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.63 
 
 		 346 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346697  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3912  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.89 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0946  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.32 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4250  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.92 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2122  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.17 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1996  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.32 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.209677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0766  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.01 
 
 		 327 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0048  tRNA-dihydrouridine synthase A  28.57 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1714  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.32 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.073679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1227  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.62 
 
 		 339 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3621  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.82 
 
 		 336 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00174952  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0371  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.62 
 
 		 339 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.167917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1829  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.62 
 
 		 339 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.76295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1843  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.62 
 
 		 339 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114221  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0790  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.62 
 
 		 339 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.54694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1989  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.25 
 
 		 351 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.931204  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00131  tRNA-dihydrouridine synthase A  26.71 
 
 		 334 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0438823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1544  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.45 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0761  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.5 
 
 		 343 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00024082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1621  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.41 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4378  tRNA-dihydrouridine synthase A  35.16 
 
 		 327 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.016037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3243  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.98 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.021676  hitchhiker  0.00000290889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0718  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.59 
 
 		 334 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00191335  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2491  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.88 
 
 		 347 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815058  normal  0.0558727 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00131  tRNA-dihydrouridine synthase A  27.76 
 
 		 334 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0765637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0746  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.59 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3123  tRNA-dihydrouridine synthase A  28.68 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3585  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.08 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0799  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.7 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0774  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.7 
 
 		 339 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.638276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0863  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.56 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0970  tRNA-dihydrouridine synthase A  27.99 
 
 		 353 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.5228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0806  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.7 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0856  tRNA-dihydrouridine synthase A  29.56 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2060  tRNA-dihydrouridine synthase A  32.7 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228828  normal  0.237445 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0743  tRNA-dihydrouridine synthase A  30.16 
 
 		 362 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1043  tRNA-dihydrouridine synthase A  27.99 
 
 		 328 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.648641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4290  tRNA-dihydrouridine synthase A  31.64 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1050  tRNA-dihydrouridine synthase A  26.45 
 
 		 335 aa  104  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>