More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24978 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  74.74 
 
 
507 aa  750    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  74.26 
 
 
505 aa  725    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  73.03 
 
 
515 aa  741    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  75.84 
 
 
508 aa  760    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  100 
 
 
506 aa  1040    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.48 
 
 
459 aa  581  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  57.61 
 
 
460 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.67 
 
 
472 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  57.14 
 
 
469 aa  552  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  56.87 
 
 
461 aa  550  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  54.76 
 
 
462 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  55.72 
 
 
459 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  54.55 
 
 
462 aa  546  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  54.53 
 
 
464 aa  547  1e-154  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  54.76 
 
 
462 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  54.33 
 
 
462 aa  545  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  56.46 
 
 
460 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  56.46 
 
 
460 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  56.01 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  56.2 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  56.22 
 
 
460 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  57.86 
 
 
466 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  56.22 
 
 
462 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.43 
 
 
466 aa  535  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  55.3 
 
 
471 aa  533  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  55.46 
 
 
460 aa  533  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  54.9 
 
 
461 aa  534  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  55.7 
 
 
464 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  57.56 
 
 
471 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  54.74 
 
 
460 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  53.39 
 
 
455 aa  529  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  55 
 
 
460 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  55.39 
 
 
458 aa  526  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.78 
 
 
466 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  54.29 
 
 
470 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  54.68 
 
 
474 aa  525  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  54.21 
 
 
460 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  53.91 
 
 
463 aa  519  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  54.98 
 
 
463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  53.9 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.36 
 
 
459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  54.15 
 
 
463 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  54.11 
 
 
466 aa  510  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  52.18 
 
 
477 aa  488  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  50.98 
 
 
472 aa  488  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  48.73 
 
 
479 aa  478  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  50.66 
 
 
460 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  49.03 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  49.03 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  48.38 
 
 
467 aa  464  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  48.38 
 
 
467 aa  464  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  50.88 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.56 
 
 
455 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  47.49 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 
475 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  50.33 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  50.44 
 
 
477 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  46.74 
 
 
440 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.86 
 
 
466 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.67 
 
 
458 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  36.73 
 
 
452 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  35.91 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  36.3 
 
 
431 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  34.91 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  34.61 
 
 
434 aa  244  3.9999999999999997e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  34.27 
 
 
439 aa  233  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  39.88 
 
 
440 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  28.98 
 
 
427 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  28.98 
 
 
438 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  27.86 
 
 
443 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  27.06 
 
 
465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  26.5 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  25.95 
 
 
437 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  30.89 
 
 
550 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  30.35 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  28.28 
 
 
437 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  26.56 
 
 
464 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0131  ATP synthase F1, alpha subunit  30.27 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  28.1 
 
 
452 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  26.83 
 
 
446 aa  130  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0655  F0F1 ATP synthase subunit alpha  29.43 
 
 
513 aa  129  9.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.245583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  31.35 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  31.33 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  28.21 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  32.19 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  29.75 
 
 
552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  28.17 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  30.24 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.21 
 
 
452 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  26.22 
 
 
464 aa  128  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  28.11 
 
 
443 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  32.51 
 
 
460 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  26.37 
 
 
437 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.27 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.27 
 
 
449 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  28.07 
 
 
545 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  25.82 
 
 
458 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  26.79 
 
 
480 aa  127  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  27.03 
 
 
442 aa  127  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  26.08 
 
 
465 aa  126  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>