More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0736 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  59.79 
 
 		 191 aa  247  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  60.67 
 
 		 198 aa  231  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  55 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  59.79 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  55.26 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  56.08 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0851  Ribonuclease H  55.34 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  53.51 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  53.37 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  52.22 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.53 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  54.26 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  51.14 
 
 		 256 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50.57 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  52.57 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  51.43 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  49.72 
 
 		 203 aa  164  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  51.14 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  50.56 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  49.17 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  50.83 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  46.96 
 
 		 221 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  48.3 
 
 		 256 aa  157  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  44.63 
 
 		 255 aa  157  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  44.63 
 
 		 255 aa  157  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  45.96 
 
 		 257 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  48 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  48.6 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.49 
 
 		 227 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  49.46 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  50 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 257 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  44.34 
 
 		 263 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 260 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 299 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  46.63 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.75 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  50.57 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.56 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 253 aa  151  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  49.43 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.51 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  47.34 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  44.74 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.31 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>