183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0043 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  100 
 
 
777 aa  1618  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.89 
 
 
618 aa  563  1e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.6 
 
 
762 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.27 
 
 
613 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.81 
 
 
542 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.43 
 
 
790 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.63 
 
 
766 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.7 
 
 
634 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.41 
 
 
553 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.42 
 
 
905 aa  493  1e-138  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.07 
 
 
609 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.18 
 
 
795 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.54 
 
 
613 aa  466  1e-130  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.88 
 
 
775 aa  465  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.87 
 
 
779 aa  455  1e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.88 
 
 
774 aa  441  1e-122  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.34 
 
 
533 aa  439  1e-122  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
772 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  38.54 
 
 
795 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  6.68214e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.41 
 
 
618 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.77 
 
 
526 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.28 
 
 
549 aa  405  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.83 
 
 
781 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.91 
 
 
605 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.24 
 
 
785 aa  400  1e-110  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  40.07 
 
 
736 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.51 
 
 
765 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.61 
 
 
812 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  1.6014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.61 
 
 
812 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  34.29 
 
 
776 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.2 
 
 
821 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.14 
 
 
505 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.05 
 
 
779 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.23 
 
 
655 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.05 
 
 
760 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.13 
 
 
534 aa  361  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.99 
 
 
527 aa  349  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 
834 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.6 
 
 
469 aa  328  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.84 
 
 
639 aa  322  2e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.17 
 
 
534 aa  321  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.58 
 
 
665 aa  317  7e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  37.6 
 
 
637 aa  310  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  36.45 
 
 
639 aa  308  2e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.18 
 
 
529 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  35.55 
 
 
558 aa  305  1e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
546 aa  305  2e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37 
 
 
549 aa  305  2e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.19 
 
 
481 aa  304  5e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  34.87 
 
 
602 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.76 
 
 
422 aa  285  2e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.52 
 
 
525 aa  285  2e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  35.99 
 
 
525 aa  285  2e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.69 
 
 
688 aa  284  5e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 
628 aa  283  8e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
545 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.13 
 
 
794 aa  275  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.1 
 
 
614 aa  273  8e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 
688 aa  273  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
543 aa  271  3e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.7 
 
 
816 aa  269  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 
515 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.22 
 
 
683 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.71 
 
 
636 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 
636 aa  267  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
584 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 
639 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.01 
 
 
593 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
528 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.78 
 
 
547 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 
858 aa  256  2e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.03 
 
 
639 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 
797 aa  251  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 
627 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.68 
 
 
447 aa  244  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.02 
 
 
533 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.31 
 
 
493 aa  243  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.02 
 
 
820 aa  240  7e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.94 
 
 
852 aa  237  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.21 
 
 
811 aa  234  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.02 
 
 
504 aa  227  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  31.87 
 
 
1140 aa  227  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.99 
 
 
863 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.64 
 
 
676 aa  223  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.28 
 
 
807 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.26 
 
 
778 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 
518 aa  216  1e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.77 
 
 
868 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.9 
 
 
866 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.04 
 
 
857 aa  208  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
489 aa  197  5e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 
673 aa  197  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.73 
 
 
673 aa  197  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.8 
 
 
500 aa  176  2e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.32 
 
 
853 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.34 
 
 
885 aa  171  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  26.03 
 
 
881 aa  170  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.95 
 
 
530 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  26.38 
 
 
889 aa  167  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  28.85 
 
 
883 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>