84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1717 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
200 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  75.66 
 
 
196 aa  314  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  75.13 
 
 
196 aa  313  2e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  63.64 
 
 
196 aa  263  9e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.45 
 
 
205 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  38.17 
 
 
194 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  36.51 
 
 
196 aa  133  1e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  37.43 
 
 
190 aa  130  2e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36.46 
 
 
214 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.14 
 
 
208 aa  120  2e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  39.57 
 
 
218 aa  119  4e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  36.11 
 
 
255 aa  119  4e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  37.04 
 
 
204 aa  119  4e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  37.17 
 
 
206 aa  118  5e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  39.89 
 
 
545 aa  116  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  35 
 
 
210 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.43 
 
 
544 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  36.9 
 
 
218 aa  114  7e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  35.11 
 
 
214 aa  111  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 
199 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  35.11 
 
 
214 aa  110  1e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.03 
 
 
550 aa  110  1e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.57 
 
 
214 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  32.26 
 
 
215 aa  108  4e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  33.16 
 
 
216 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.38 
 
 
212 aa  107  9e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.34 
 
 
570 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  34.22 
 
 
212 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  31.86 
 
 
220 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.16 
 
 
212 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.51 
 
 
212 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
209 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.63 
 
 
193 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.67 
 
 
553 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.36 
 
 
211 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  29.59 
 
 
222 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  32.12 
 
 
216 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.38 
 
 
559 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30 
 
 
224 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.58 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  31.96 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.31 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  8.54832e-05  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  33.16 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.22 
 
 
598 aa  99  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  29.44 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.22 
 
 
580 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  30.88 
 
 
333 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  27.55 
 
 
225 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.55 
 
 
594 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.22 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.51 
 
 
190 aa  89.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.27 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.65 
 
 
190 aa  84  1e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  29.15 
 
 
234 aa  82  5e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.48 
 
 
218 aa  78.6  6e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.63 
 
 
198 aa  71.6  7e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.08 
 
 
558 aa  70.5  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 
202 aa  65.1  7e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.73 
 
 
190 aa  64.3  1e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.12 
 
 
198 aa  62  5e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  27.42 
 
 
189 aa  60.8  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  31.4 
 
 
170 aa  54.3  1e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  27.87 
 
 
170 aa  48.5  6e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  21.99 
 
 
220 aa  48.1  8e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.26 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  35.54 
 
 
171 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  21.65 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.3 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  22.4 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  21.08 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.76 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  23.33 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.37 
 
 
172 aa  45.1  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  21.08 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  26.96 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.83 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.16 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  22.1 
 
 
525 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  27.2 
 
 
323 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  27.42 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.07 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.27 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  31.03 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>